临床上，通过检测血浆或组织中的纤维连接蛋白水平，可辅助多种疾病的诊断和病情监测。在感染性疾病中，如败血症，患者血浆纤维连接蛋白水平会显著下降，可作为评估病情严重程度和预后的指标。在肝脏疾病中，肝硬化患者血清纤维连接蛋白含量低于正常水平，且与肝功能损害程度相关，动态监测纤维连接蛋白水平有助于判断肝硬化的发展阶段和治疗效果。在肿瘤诊断方面，某些肿瘤患者血清或肿瘤组织中的纤维连接蛋白表达异常，虽然不能作为单一的肿瘤标志物，但与其他指标联合检测，可提高肿瘤诊断的准确性和特异性，为临床治疗方案的制定提供依据。​